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【网络讲座】数学与统计学院学术报告会:Modeling and Analysis of Non-markovian Reaction Systems等(时间6.14)

发布时间:2020-06-13 17:47:00

 讲座1:Modeling and Analysis of Non-markovian Reaction Systems 周天寿教授,时间6月14日9:30,腾讯会议ID:985 175 064 密 码:123456

生化反应网络是描述细胞过程的重要工具。以前的研究假设生化反应事件是以马氏方式发生的,但最近的实验表明:生化反应事件是非马氏的。对于非马氏反应网络,如何建模与分析是一项挑战性任务。我们对任意的非马氏反应网络,研发出一套建模方法,它把一个非马氏问题转化成马氏问题。而且,我们发现:尽管非马氏行为可能非常复杂,但随着时间演化,系统行为最终趋于马氏行为。

 

讲座2:基于单细胞数据的伪时间轨迹预测,田天海教授,时间时间6月14日10:30,腾讯会议ID:985 175 064 密 码:123456。

单细胞实验是在单个细胞水平上测量基因或者蛋白的活性。和传统的基于大量细胞的生物实验不同,单细胞数据提供了前所未有的机会来分析细胞间的异值性。但这类不具备时间序列特征的实验数据给数学建模带来了巨大的挑战,因此单细胞数据分析的重要一步是根据细胞进化过程的特征将每个单细胞在“伪时间轨迹”上排序,然后再对具有“时间序列”特征的数据进行数学分析。本报告将汇报近年来我们在基于单细胞数据的伪时间轨迹预测方面做的工作。主要是介绍SCOUT和DTFLOE二个算法。

 

 周天寿,教授,博士生导师,数学研究所所长,广东省计算数学重点实验室副主任,中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会副主任,中国运筹学会计算系统生物学专业委员会副主任。研究方向:计算系统生物学。在国内外学术刊物发表论文172篇,其中SCI论文150余篇,包括国际重要学术期刊Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America(PNAS)(2019年)和Physical Review Letters(PRL)(2005年和2014年),其中2005年发表在PRL上的论文被诺贝尔获得者加州理工学院教授Frances H. Arnold引用,并被Harvard大学教授M. Springer和J. Paulsson在Nature上作了专门评论。分别于2009年和2019年在科学出版社出版学术专著2部。2003年获全国优秀博士学位论文奖,2008年获国家自然科学二等奖,2009年获南粤优秀科技创新论文一等奖。目前,担任四个国际学术刊物的编委,包括国际著名综述期刊Current Opinion in Systems Biology 。

 田天海,澳大利亚莫那什大学数学学院教授。2001年在澳大利亚昆士兰大学取得博士学位,博士毕业后曾在澳大利亚昆士兰大学,英国格拉斯哥大学等一流大学工作。在基因网络和细胞信号传导等生物系统的随机建模,随机动力系统的数值模拟,模型参数估计,和统计分析与计算等方向开展过很多有创新意义的工作,并取得了较多的研究成果。主持过澳大利亚研究基金会(ARC)研究项目3项,主持国家自然科学基金面上项目一项,参与澳大利亚研究基金会(ARC)研究项目2项(其中一项的研究员基金为计划单列),参与英国生物工程和生物科学基金会(BBSRC)研究项目1项。 其研究还得到了(英国)皇家科学院,英国癌症基金会和澳大利亚科学院的支持。获得过澳大利亚研究基金会的“未来研究员”(Future Fellow)和“澳大利亚研究员”(Australian Fellow)以及格拉斯哥大学“凯尔文爵士研究员”(Lord Kelvin Fellow)等称号。其研究成果己发表在高级别的学术刊物上,包括“自然杂志细胞生物学分刊”,“美国国家科学院会刊”和“当代生物学”等杂志。发表120多篇学术论文,其中有70篇学术论文被SCI收录,被他人SCI引用1400多次。

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